Koroonapandeemia aegsed COVID-19 haigusega seotud avaandmed

Siin avaldatud andmestikud enam ei uuene.

COVID-19 vastu vaktsineerimine

Statistikasse kaasati COVID-19 vastu teostatud vaktsineerimised, mis edastati terviseteenuse osutajate (haiglate, perearstide, vaktsineerimisi läbiviivate asutuste) poolt tervise infosüsteemi immuniseerimise teatise dokumentidel. Iga päev fikseeritakse viimase 24 tunni seis kõige värskemate andmete põhjal.

Statistika kuupäevaks (StatisticsDate) ehk kuupäevaks, mille kohta andmed kehtivad, arvestatakse vaktsineerimise andmete tervise infosüsteemi laekumise aega, mitte vaktsineerimise kuupäeva. Sõltuvalt terviseteenuse osutajast võib andmete laekumisel esineda mõnepäevane viide. Terviseteenuse osutajatel on õigus ja kohustus vigade tuvastamisel teha andmetes parandusi, mis võivad mõjutada tagasiulatuvalt ka avaandmeid.

Patsiendi vaktsineerimise staatus (VaccinationSeries, MeasurementType) arvutatakse välja, tuginedes immuniseerimise teatistele ning andmetele COVID-19 haiguse läbipõdemise kohta. Andmed COVID-19 haiguse läbipõdemise kohta saadakse, tuginedes SARS-CoV-2 RNA PCR ja antigeeni testidele ja arsti poolt epikriisidel pandud diagnoosidele.

Vaktsineerimiskuuri (VaccinationSeries) väärtused võivad olla järgmised:

• VaccinationSeries = 1 väärtuseks loetakse esmane läbiviidud vaktsineerimine. Selle hulka võib kuuluda tavapärase vaktsineerimise käigus kaks doosi kahedoosilisest vaktsiinist või üks doos ühedoosilisest vaktsiinist või üks doos kahedoosilisest vaktsiinist kombinatsioonis läbipõdemisega.
• VaccinationSeries = 2 alla loetakse esimese lisa- ja tõhustusdoosiga vaktsineerimine.
• VaccinationSeries = n alla loetakse n-1 lisa- ja tõhustusdoosiga vaktsineerimised.

MeasurementType mõõdik näitab, mille kohta konkreetse päeva agregeeritud näitajad käivad. Võimalikud väärtused on järgmised:

• Vaccinated alla loetakse kõik inimesed, kes on saanud vähemalt ühe doosi vaktsiini.
• FullyVaccinated alla loetakse inimesed, kes on vaktsineerimiskuuri nõuetekohaselt lõpetanud (saanud vastavalt kas esimeses kuuris kaks doosi kahedoosilisest vaktsiinist, ühe doosi ühedoosilisest vaktsiinist või ühe doosi ja haiguse läbi põdenud).
• DosesAdministered alla loetakse mitte inimesi vaid manustatud süste antud vaktsineerimiskuuri lõikes.

Andmestikke kasutades peab tähele panema, et mõõdiku MeasurementType lõikes ei saa kokku liita Vaccinated ja FullyVaccinated, kuna FullyVaccinated on juba hulga Vaccinated osa. See tähendab, et kõik inimesed, kes on täielikult vaktsineeritud kajastuvad ka Vaccinated hulgas.

Samuti ei saa summeerida inimesi üle vaktsineerimiskuuride: kui inimene esineb VaccinationSeries = 2 hulgas, siis ta kajastub ka VaccinationSeries = 1 hulgas, kui inimene esineb VaccinationSeries = 3 hulgas, siis ta kajastub ka VaccinationSeries = 2 ja VaccinationSeries = 1 hulgas jne.

Summeerida võib DosesAdministered koguseid, kuna siinkohal kajastatakse vaktsiinidoose.

Teoreetiliselt on võimalik, et teatud kitsastes grupeeringutes või dimensioonide lõikes võib juhtuda, elanikkonna vaktsineerimisega hõlmatus ületab 100% määra. Põhjuseid selleks võib olla mitu:

• Elanike arv tugineb Statistikaameti aasta alguse andmetele ning hilisema seisuga tegelik rahvastikuregistri järgne sissekirjutuste arv konkreetses asukohas, soo ja vanuserühma lõikes võib olla suurem.
• Teadmata elukohaga inimesed kajastuvad statistikas nagu kõik teisedki, kuid nende osas on hõlmatust keeruline arvutada. Seetõttu esineb juhtumeid, kus mõnes asukohas, soo ja vanuserühma lõikes, on hõlmatuse määr oluliselt suurem kui 100%.

Meeles peab pidama, et kui andmestikus on välja arvutatud vaktsineerimisega hõlmatus (PopulationCoverage), siis andmeid analüüsides erinevate agregeeringute või grupeeringute lõikes, tuleb hõlmatus kindlasti uuesti välja arvutada. Hõlmatus kujutab endast protsentarvutust: konkreetse päeva seisu koguarv (TotalCount) jagatud elanike arvuga (LocationPopulation). Protsente omavahel liita ei tohi. Üle arvutamiseks tuleb kasutada valitud agregeeringu lõikes valemit:

PopulationCoverage = 100 * SUM(TotalCount) / SUM(LocationPopulation)

Arvutuse juures peab aga täielike aegridade korral olema filter statistika kuupäeva (StatisticsDate) andmeväljal või arvutus olema tehtud StatisticsDate dimensiooni sees.

COVID-19 vastu vaktsineerimise andmestikega saab tutvuda siin.

SARS-CoV-2 testimine

Statistikasse kaasati terviseteenuse osutajate poolt (haiglad, laborid, arstid) tervise infosüsteemi saadetud COVID-19 testide tulemused saatekirja vastuste dokumentide põhjal. Iga päev fikseeriti viimase 24 tunni seis kõige värskemate andmete alusel.

Statistikasse arvestati SARS koroonaviirus 2 RNA ja antigeeni analüüsid vastavalt järgmistele LOINC koodidele:

Antikehade analüüse statistikas ei kajastata.

SARS-Cov-2 testimise andmestikega saab tutvuda siin.

COVID-19 haiglaravi

Statistika COVID-19 haigusega haiglaravil viibivate patsientide kohta perioodil 26.02.2020 kuni 01.05.2023. Andmed põhinevad pandeemia perioodil haiglate poolt igapäevaselt raporteeritud seisule. Seis fikseeriti hommikul kell 10.30.

Andmestikud kajastavad patsientide hospitaliseerimisi, haigusjuhtumeid ja haiglas viibimise fakti.

Hospitaliseerimiseks loetakse iga uut haiglasse sisse kirjutamist.

Haiglaravi haigusjuhtumiks loetakse ajaliselt järjestikku toimunud hospitaliseerimisi: näiteks, kui patsient võetakse vastu haiglasse A ning viiakse üle haiglasse B, siis on tegemist uue hospitaliseerimisega, aga mitte uue haigusjuhtumiga.

Haiglaravi andmete uurimisel peab arvestama andmete volatiilsusega järgmistel põhjustel:

• tagantjärele andmete edastamine - näiteks sissekirjutamise päeval ei jõutud selle patsiendi kohta veel andmeid edastada ning edastatakse järgneval päeval;
• tagantjärele väljakirjutamine - kui näiteks väljakirjutamise päeval ei jõutud selle patsiendi väljakirjutamise kohta veel andmeid edastada ning edastatakse järgmisel päeval;
• haiglate vahel viibimine - kui patsient on andmete fikseerimise hetkel ühest haiglast välja kirjutatud ning suunatud teise haiglasse ravile ja uus haigla ei ole patsiendi vastu võtmise kohta veel infot edastanud, võib see patsient statistikas kajastuda kui haiglast välja kirjutatu;
• haiglate suur töökoormus pandeemia perioodil ning kitsas andmete fikseerimise ajavahemik - suurte mahtude juures võib esineda kõrvalekaldeid ja kõikumisi.

Andmestikud COVID-19 haiglaravi kohta on seisuga 01.05.2023. Uusi andmeid ei avaldata. Avaldamine lõppes seoses COVID-19 hädaolukorra lahendamise lõppemisega Eestis 02.05.2023.

COVID-19 haiglaravi andmestikega saab tutvuda siin.